Program Studi Manajemen Pendidikan Islam (MPI) yang memiliki visi “Unggul dalam Pengembangan Ilmu Manajemen Pendidikan Islam berbasis masyarakat multikultural di Kawasan Asia Tenggara tahun 2035”, merupakan salah satu program studi pada Fakultas Tarbiyah dan Ilmu Keguruan IAIN Manado yang didirikan berdasarkan Keputusan Direktur Jenderal Pendidikan Islam, Nomor: Dj.I/614/2009 Tentang Izin Pembukaan Program Studi Strata 1 (S.1) pada Perguruan Tinggi Agama Islam Tahun 2009 (download di sini)
Pada tahun 2018, Prodi MPI telah terakreditasi “B”, Berdasarkan SK Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi (BAN-PT) No. 852/SK/BAN-PT/Akred/S/III/2018
